Městská policie je také společně s hasičským záchranným sborem, policií ČR a zdravotní záchrannou službou součástí integrovaného záchranného systému, kam byla začleněna koncem roku 1999. Pokud je potřeba, záchranné složky se na místo mimořádné události sjíždí téměř současně. Koordinace je zajištěna operačním a informačním střediskem IZS, které zřídil bývalý Okresní úřad Mělník, kde bylo toto středisko i prozatím umístěno. V současné době je středisko přestěhováno do prostor Hasičského záchranného sboru Mělník v ul. Bezručova. Stálé spojení mezi operačními středisky všech začleněných složek zajišťuje vybudovaná radiová síť IZS. Vzhledem k nepřetržité pracovní době je městská policie kdykoli připravena plnit úkoly v případě mimořádné události na území města. Nutnost účasti městské policie v této složce jednoznačně potvrzují každoročně se opakující povodně.